Cities: Skylines II에는 지상, 대기, 수질, 지하수, 소음 공해의 5가지 오염 유형이 있다.
지상 오염
토양 오염은 육안으로 볼 수 있으며 변색된 토양으로 나타나며 다음과 같은 영향을 미친다.
토양오염은 농업과 임업, 특수산업을 제외한 주로 산업에 의해 발생하고 있다. 이는 또한 화석연료 발전소 및 폐기물 관리 건물과 같이 주변에 오염을 유발하는 공간이 있는 다른 오염 건물에 의해서도 발생한다. 오염원을 제거하더라도 토양오염이 사라지는 데는 시간이 좀 걸릴 것이다. 무공해 건물에 오랫동안 수거되지 않은 쓰레기가 있으면 땅도 오염된다. 하수는 특히 배출구나 처리장 근처에서 토양 오염을 일으킬 수 있다. 물의 흐름은 토양 오염을 제거하지만 건물이 오염을 재개할 때까지만 가능하다.
지하수 오염
토양 오염이 지하수와 접촉하면 전체 퇴적물이 빠르게 오염된다. 토양오염이 제거되면 지하수 오염은 매장지의 보충율과 동일하게 사라진다. 오염된 지하수를 도시의 수자원망으로 퍼올린다면 모든 시민의 건강이 빠르게 감소할 것이다.
대기 오염
대기 오염은 주거 구역 근처에 있는 경우 시민' 건강을 저하시킨다. 대기 오염은 바람의 방향에 따라 이동하며 오염되지 않은 공기와 혼합되면서 팽창하고 희석된다. 비는 대기 오염을 줄여준다.
대기오염은 농업과 임업, 특수산업을 제외하고 주로 교통과 산업에 의해 발생한다. 이는 또한 화석연료 발전소 및 폐기물 관리 건물과 같이 주변에 오염을 유발하는 공간이 있는 다른 오염 건물에 의해서도 발생한다. 오염원을 제거하더라도 대기오염이 사라지는 데는 시간이 좀 걸릴 것이다. 오염되지 않은 건물에 오랫동안 수거되지 않은 쓰레기가 있으면 공기도 오염된다. 하수는 특히 배출구나 처리장 근처에서 대기 오염을 일으킬 수 있다.
전기 자동차와 버스는 대기 오염을 배출하지 않으므로 플레이어가 대기 오염을 줄이고 싶다면 훌륭한 선택이 된다.
수질 오염
수질 오염은 하수가 물로 펌핑되거나 토양 오염이 물 근처에 닿을 때 발생한다. 수질 오염은 물의 흐름과 함께 이동하며 오염되지 않은 물과 혼합되면서 팽창하고 희석된다. 도시의 물 네트워크에 오염된 물을 퍼 올리는 경우 모든 시민의 건강이 급격히 감소하므로 물을 오염시키는 것을 방지하기 위해 양수장과 하수 배출구 배치를 계획하는 것이 중요하다. 플레이어는 또한 오염된 지하수 퇴적물 위에 지하수 펌프장을 배치하는 것을 주의해야 한다. 물 정보뷰와 지표수 흐름 오버레이를 검사하면 지도에서 물 흐름의 방향과 강도에 대한 정보를 얻을 수 있다.
소음 공해
주거 구역 근처에 있으면 소음으로 인해 시민'의 복지 저하된다. 소음공해는 교통, 산업, 상업 구역으로 인해 발생한다. 또한 주변 지역이 오염되는 다양한 건물로 인해 발생한다.
도로에서는 "교통량이 많을수록 소음도 커진다"는 일반적인 규칙이 있다. 차량의 각 유형에는 소음 공해 등급이 있으므로 교통 소음의 양은 도로에 교통량이 얼마나 많은지뿐만 아니라 어떤 유형의 차량이 있는지에 따라 달라진다. 대형 트럭은 일반적으로 더 많은 소음을 발생시킨다.
도로 나무와 고속도로에 방음벽을 설치하면 차량에서 발생하는 소음을 줄이는 데 도움이 된다. 지하 도로는 차량이 발생하는 소음을 완벽하게 억제된다. 그러나 고가 도로는 소음 공해를 증가시킨다.
나무는 소음 공해를 줄여주지만, 상당한 효과를 보려면 대량으로 사용해야 한다.